La fumagilline est une substance produite par la fermentation d' Aspergillus fumigatusqui a des effets inhibiteurs puissants in vitro rispetto a un certo numero di specie di microsporidi.
Il meccanismo attraverso il quale la fumagillina esercita il suo microsporidiale di attività antiparassita non è chiaramente stabilito. La citochimica suggerisce che la fumagillina inibisce la sintesi dell'RNA (acido ribonucleico) in parassita.
I dati recenti supportano fortemente l'ipotesi che il metionine aminopeptidasi -2 è il bersaglio molecolare microsporide.